Das WIN-Kolleg
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renzierung verursacht, während sie von miR-369-5p, durch direkte Beeinflussung
von FABP4, runterreguliert wird. Diese Veränderungen gehen mit der Hoch- bzw.
Runterregulierung der DNA-Methyltransferasen 3A und 3B (DNMT3A/B) einher.
miR-371 und miR-369-5p konnten somit als antagonistische up-stream-Regulato-
ren der adipogenen Differenzierung durch indirekte Vermittlung epigenetischer
Modifikationen identifiziert werden11. Diese Ergebnisse zeigen, dass auch miRNAs
am Prozess der replikativen Seneszenz beteiligt sind und in diesem Rahmen mitun-
ter die Differenzierung von MSC über epigenetische Modifikation regulieren.
2.2. Vergleichende Untersuchungen in MSC aus AML-Patienten
Durch die Untersuchung der Genexpression und der epigenetischen Profile von
MSC aus AML-Patienten und gesunden Spendern können nicht nur Unterschiede
im Charakter dieser Zellen analysiert werden, sondern durch die Verwendung neuer
Analysetechniken zusätzlich noch tiefere Einblicke in die molekularen Ursachen
bzw. Effekte der replikativen Seneszenz gewährt werden. Dabei verwenden wir zur
Untersuchung der Genexpression den GeneChip Human Gene 1.0 ST Array von
Afiymetrix mit einem Gen-Set von über 47.000 Transkripten. Für die epigeneti-
schen Untersuchungen wird der Illumina 450k Methylation Array verwendet, geeig-
net für die Analyse von über 450.000 Methylierungspositionen pro Probe mit Ein-
zelnukleotidauflösung. Die für diese Versuche verwendeten Proben sowie Eckdaten
der Spender und Patienten sind in Tabelle 1 ersichtlich, Wachstumskurven und
-frequenzen in Abbildung 3.
Tabelle 1:
A) MSC from newly diagnosed AML patients
Patient
Year of
birth
Gender
DNA/RNA
Pe
DNA/RNA
Ps
KM37
1950
female
P2
P7
KM44
1946
male
P2
—
KM50
1968
female
P2
P6
KM55
1942
male
P2
P3
KM56
1941
male
P1
—
KM69
1931
female
P2
P5
KM70
1930
female
P2
KM72
1984
female
P2
B) MSC from healthy donors
Donor
Year of
birth
Gender
DNA/RNA
Pe
DNA/RNA
Ps
338
1969
male
P2
P7
340
1968
male
P2
P8
341
1959
male
P2
P6
343
1957
female
P2
P7
344
1978
male
P2
P9
355
1987
male
P2
P10
Pe = frühe Passage, Ps = späte Passage
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renzierung verursacht, während sie von miR-369-5p, durch direkte Beeinflussung
von FABP4, runterreguliert wird. Diese Veränderungen gehen mit der Hoch- bzw.
Runterregulierung der DNA-Methyltransferasen 3A und 3B (DNMT3A/B) einher.
miR-371 und miR-369-5p konnten somit als antagonistische up-stream-Regulato-
ren der adipogenen Differenzierung durch indirekte Vermittlung epigenetischer
Modifikationen identifiziert werden11. Diese Ergebnisse zeigen, dass auch miRNAs
am Prozess der replikativen Seneszenz beteiligt sind und in diesem Rahmen mitun-
ter die Differenzierung von MSC über epigenetische Modifikation regulieren.
2.2. Vergleichende Untersuchungen in MSC aus AML-Patienten
Durch die Untersuchung der Genexpression und der epigenetischen Profile von
MSC aus AML-Patienten und gesunden Spendern können nicht nur Unterschiede
im Charakter dieser Zellen analysiert werden, sondern durch die Verwendung neuer
Analysetechniken zusätzlich noch tiefere Einblicke in die molekularen Ursachen
bzw. Effekte der replikativen Seneszenz gewährt werden. Dabei verwenden wir zur
Untersuchung der Genexpression den GeneChip Human Gene 1.0 ST Array von
Afiymetrix mit einem Gen-Set von über 47.000 Transkripten. Für die epigeneti-
schen Untersuchungen wird der Illumina 450k Methylation Array verwendet, geeig-
net für die Analyse von über 450.000 Methylierungspositionen pro Probe mit Ein-
zelnukleotidauflösung. Die für diese Versuche verwendeten Proben sowie Eckdaten
der Spender und Patienten sind in Tabelle 1 ersichtlich, Wachstumskurven und
-frequenzen in Abbildung 3.
Tabelle 1:
A) MSC from newly diagnosed AML patients
Patient
Year of
birth
Gender
DNA/RNA
Pe
DNA/RNA
Ps
KM37
1950
female
P2
P7
KM44
1946
male
P2
—
KM50
1968
female
P2
P6
KM55
1942
male
P2
P3
KM56
1941
male
P1
—
KM69
1931
female
P2
P5
KM70
1930
female
P2
KM72
1984
female
P2
B) MSC from healthy donors
Donor
Year of
birth
Gender
DNA/RNA
Pe
DNA/RNA
Ps
338
1969
male
P2
P7
340
1968
male
P2
P8
341
1959
male
P2
P6
343
1957
female
P2
P7
344
1978
male
P2
P9
355
1987
male
P2
P10
Pe = frühe Passage, Ps = späte Passage